中文名称: 新型固定组织基因组DNA提取试剂盒
英文名称: FFPE DNA kit
CAS No:
PS1372 新型固定组织基因组DNA提取试剂盒 (psaitong)
产品简介:
本产品适用于从福尔马林固定、石蜡包埋组织中有效纯化基因组DNA。本品使用专门优化脱蜡剂和裂解液,释放福尔马林固定或组织切片样本中的DNA,不涉及有机试剂二甲苯,无需过夜操作;消化后的样品在较高的温度孵育后,去除游离DNA的福尔马林交联,有效提高DNA的产量和纯度;优化的缓冲系统使裂解液中的DNA可特异结合到吸附膜上,抑制剂通过两步漂洗步骤有效去除,最后使用低盐缓冲液或水洗脱,即可获得高纯度DNA。同时配置高效微量吸附柱,洗脱体积可低至20μl。经过纯化的DNA可以直接用于PCR、Real-timePCR、SNP基因分型、STR基因分型、二代测序和药物基因组学研究等。从福尔马林固定、石蜡包埋样本中分离的DNA分子量通常低于新鲜或冷冻样本中的DNA。DNA片段化的程度取决于样本类型、储存时间以及固定的条件。
操作步骤:
一:石蜡包埋样本
1:用手术刀将组织块中多余的石蜡修剪掉,露出组织后切成5-10μm的薄片。
2:取约1×1cm2的切片(共约3-8片切片)置于离心管(自备)中,加入160μlBufferDS,涡旋震荡10秒。短暂离心将样本收集到管底。56°C孵育3分钟,水浴锅中取出后静置,降至室温后进行下一步操作。
注意:如果样品表面暴露在空气中,最初的2-3片弃掉不用。
3:上述管中加入180μlBufferGTL,涡旋震荡混匀,12,000rpm离心1分钟,溶液分为两层。取20μlProteinaseK加入到下层溶液中,移液器小心吹吸混匀。
4:56̊C孵育1小时,直至样品完全溶解。90̊C孵育1小时。12,000rpm离心1分钟,使用200μl枪头沿管壁小心吸取下层的水相于新的离心管中。
注意:此步骤的目的是修复由甲醛变性的核酸,孵育的温度过高或时间过长可能造成DNA断裂,产生DNA碎片。
56̊C孵育后的样品可置于室温,直至水浴锅或干浴锅温度达到90̊C后再把样品置于90̊C孵育。如需除去RNA,可将样品温度降到室温后,加入2μl浓度为100mg/ml的RNaseA溶液。
二:福尔马林等固定液中的样本
1:取约 20 mg 的样本,切成小块,置于离心管中,加入 500 μl 10mM PBS(PH7.4),涡旋振荡,12,000 rpm(~13,400×g)离心1 分钟,弃上清,重复3次。
2:上述管中加入 180 μl Buffer GTL,20 μl Proteinase K,涡旋震荡混匀。
3:56̊C 孵育 1 小时,直至样品完全溶解。90̊C 孵育1小时。短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。
注意:此步骤的目的是修复由甲醛变性的核酸,孵育的温度过高或时间过长可能造成 DNA 断裂,产生 DNA 碎片。
56̊C 孵育后的样品可置于室温,直至水浴锅或干浴锅温度达到90̊C 后再把样品置于90̊C 孵育。
4:12,000 rpm 离心 1 分钟,使用 200 μl 枪头沿管壁小心吸取上清到新的离心管中。
注意:如需除去 RNA,可将样品温度降到室温后,加入 2 μl 浓度为 100 mg/ml 的 RNase A 溶液。
以下为两种不同来源样本提取的共同步骤:
5:加入 200 μl Buffer GL,涡旋震荡混匀后加入 200 μl 无水乙醇,涡旋震荡彻底混匀。短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。
注意:加入 Buffer GL 和无水乙醇后要立即充分混匀。
加入 Buffer GL 和无水乙醇后可能会产生白色沉淀,不会影响后续实验。
如果需要对多个样品进行操作,可以将 Buffer GL 和无水乙醇事先混匀后加样。
6:将步骤 5 所得溶液全部加入已装入收集管的吸附柱(Spin Columns DF)中,若一次不能加完溶液,可分多次转入。12,000 rpm离心 1 分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
7:向吸附柱中加入 500 μl Buffer GW1(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm 离心 1 分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
8:向吸附柱中加入 500 μl Buffer GW2(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm 离心 1 分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
注意:如需进一步提高 DNA 纯度,可重复步骤8。
9:12,000 rpm 离心 2 分钟,倒掉收集管中废液。将吸附柱置于室温数分钟以彻底晾干。
注意:这一步目的是将吸附柱中残余乙醇去除,乙醇残留会影响后续酶促反应。
10:将吸附柱置于一个新的1.5 ml收集管中,向吸附柱的中间部位悬空加入 20-100 μl Buffer EB 或灭菌水,室温放置 2-5 分钟,12,000rpm离心1分钟,收集DNA 溶液,-20 ̊C 保存 DNA。
注意:洗脱液的 pH 值对洗脱效率有很大影响,若用水做洗脱液应保证其 pH 值在 7.0-8.5,pH 值低于 7.0 时洗脱效率不高。
如果要提高 DNA 的终浓度,可以将步骤10所得的DNA洗脱液重新加至吸附膜上,室温放置2分钟,12,000 rpm离心1分钟。
组分:
组分名称 50T 储存
BufferGTL 15mL RT
BufferGL 15mL RT
BufferGW1(concentrate) 13mL RT
BufferGW2(concentrate) 15mL RT
BufferEB 10mL RT
BufferDS 10mL RT
ProteinaseK 25mg -20℃
ProteinaseKStorageBuffer 1.25mL -20℃
SpinColumnsDFWithCollectionTubes 50个 RT
CentrifugeTubes(L-1.5ml) 50个 RT
注意事项:
1:获得样品后,要尽快将样品在4%-10%的福尔马林中固定,固定时间以14-24小时为宜,时间过长易导致基因组断裂,影响下游实验。如果甲醛固定时间过长或样本存放时间过久(>1年)则易导致DNA完整性受损,无法扩出长片段。
2:确保包埋前的样品彻底脱水,残留的福尔马林会抑制ProteinaseK的作用。
3:向ProteinaseK中加入1.25mlProteinaseKStorageBuffer使其溶解,-20̊C保存。配制好的ProteinaseK勿长时间室温放置,以免影响其活性。
4:第一次使用前应按试剂瓶标签说明先在BufferGW1和BufferGW2中加入无水乙醇。
5:使用前请检查BufferGTL、BufferGL和BufferDS是否出现结晶或者沉淀,如有结晶或者沉淀,请将BufferGTL、BufferGL和BufferDS于56̊C水浴重新溶解。
6:如果下游实验对RNA污染比较敏感,可以在加入BufferGL前加入2μlDNase-Free的RNaseA(100mg/ml)。
7:实验开始前将水浴锅或恒温混匀仪预热至56̊C。
保存条件:
室温 12个月
自备试剂:
无水乙醇(E20003)
UN码:
HazardClass:
危害声明:
安全说明:
搜索质检报告(COA)
参考文献 & 客户发表文献

本计算器可帮助您计算出特定溶液中溶质的质量、溶液浓度和体积之间的关系,公式为:
质量 (g) = 浓度 (mol/L) x 体积 (L) x 分子量 (g/mol)

摩尔浓度计算公式

  • =
    *
    *
    *选择对应的单位 *空出希望得到的变量,填写另外两个变量

用本工具协助配置特定浓度的溶液,使用的计算公式为:
开始浓度 x 开始体积 = 最终浓度 x 最终体积

稀释公式

稀释公式一般简略地表示为:C1V1 = C2V2 ( 输入 输出 )

  • * = *

连续稀释计算器方程

  • 连续稀释

  • 初始浓度:
  • 稀释倍数:
  • 计算结果

  • C1=C0/X C1: LOG(C1):
    C2=C1/X C2: LOG(C2):
    C3=C2/X C3: LOG(C3):
    C4=C3/X C4: LOG(C4):
    C5=C4/X C5: LOG(C5):
    C6=C5/X C6: LOG(C6):
    C7=C6/X C7: LOG(C7):
    C8=C7/X C8: LOG(C8):